Пополняю список ошибок. Клиент прислал скриншот вот с такой вот ошибкой.

com.otr.sufd.services.doc.crypto.DocApprovalException Нарушен порядок формирования списка ЭЦП. The order of signatures list is broken

Не буду многословен (клиент самостоятельно обновлял браузер, переустанавливал сертификаты и делал кучу других манипуляций), скажу как решилась проблема.

 Я попросил удалить подписи с документов и подписать в другом порядке. Что это значит? В суфд есть кнопка "удалить подпись".

Во первых смотрите каким пользователем Вы уже подписали документ. К примеру директором. Значит заходите под ним (если Вы сидели под главным бухгалтером удалить подпись директора у Вас не получится), снимаете подпись директора. Заходите под гл. бухом, подписываете, после заходите под директором - подписываете. Ошибка ушла.